Species Distribution Modelling: Contrasting presence-only models with plot abundance data

Vitor H F Gomes; Stéphanie D IJff; Niels Raes; Iêda Leão Amaral; Rafael P Salomão; Luiz de Souza Coelho; Francisca Dionízia de Almeida Matos; Carolina V Castilho; Diogenes de Andrade Lima Filho; Dairon Cárdenas López; Juan Ernesto Guevara; William E Magnusson; Oliver L Phillips; Florian Wittmann; Marcelo de Jesus Veiga Carim; Maria Pires Martins; Mariana Victória Irume; Daniel Sabatier; Jean-François Molino; Olaf S Bánki; José Renan da Silva Guimarães; Nigel C A Pitman; Maria Teresa Fernandez Piedade; Abel Monteagudo Mendoza; Bruno Garcia Luize; Eduardo Martins Venticinque; Evlyn Márcia Moraes de Leão Novo; Percy Núñez Vargas; Thiago Sanna Freire Silva; Angelo Gilberto Manzatto; John Terborgh; Neidiane Farias Costa Reis; Juan Carlos Montero; Katia Regina Casula; Beatriz S Marimon; Ben-Hur Marimon; Euridice N Honorio Coronado; Ted R Feldpausch; Alvaro Duque; Charles Eugene Zartman; Nicolás Castaño Arboleda; Timothy J Killeen; Bonifacio Mostacedo; Rodolfo Vasquez; Jochen Schöngart; Rafael L Assis; Marcelo Brilhante Medeiros; Marcelo Fragomeni Simon; Ana Andrade; William F Laurance; José Luís Camargo; Layon O Demarchi; Susan G W Laurance; Emanuelle de Sousa Farias; Henrique Eduardo Mendonça Nascimento; Juan David Cardenas Revilla; Adriano Quaresma; Flavia R C Costa; Ima Célia Guimarães Vieira; Bruno Barçante Ladvocat Cintra; Hernán Castellanos; Roel Brienen; Pablo R Stevenson; Yuri Feitosa; Joost F Duivenvoorden; Gerardo A Aymard C; Hugo F Mogollón; Natalia Targhetta; James A Comiskey; Alberto Vicentini; Aline Lopes; Gabriel Damasco; Nállarett Dávila; Roosevelt García-Villacorta; Carolina Levis; Juliana Schietti; Priscila Souza; Thaise Emilio; Alfonso Alonso; David Neill; Francisco Dallmeier; Leandro Valle Ferreira; Alejandro Araujo-Murakami; Daniel Praia; Dário Dantas do Amaral; Fernanda Antunes Carvalho; Fernanda Coelho de Souza; Kenneth Feeley; Luzmila Arroyo; Marcelo Petratti Pansonato; Rogerio Gribel; Boris Villa; Juan Carlos Licona; Paul V A Fine; Carlos Cerón; Chris Baraloto; Eliana M Jimenez; Juliana Stropp; Julien Engel; Marcos Silveira; Maria Cristina Peñuela Mora; Pascal Petronelli; Paul Maas; Raquel Thomas-Caesar; Terry W Henkel; Doug Daly; Marcos Ríos Paredes; Tim R Baker; Alfredo Fuentes; Carlos A Peres; Jerome Chave; Jose Luis Marcelo Pena; Kyle G Dexter; Miles R Silman; Peter Møller Jørgensen; Toby Pennington; Anthony Di Fiore; Fernando Cornejo Valverde; Juan Fernando Phillips; Gonzalo Rivas-Torres; Patricio von Hildebrand; Tinde R van Andel; Ademir R Ruschel; Adriana Prieto; Agustín Rudas; Bruce Hoffman; César I A Vela; Edelcilio Marques Barbosa; Egleé L Zent; George Pepe Gallardo Gonzales; Hilda Paulette Dávila Doza; Ires Paula de Andrade Miranda; Jean-Louis Guillaumet; Linder Felipe Mozombite Pinto; Luiz Carlos de Matos Bonates; Natalino Silva; Ricardo Zárate Gómez; Stanford Zent; Therany Gonzales; Vincent A Vos; Yadvinder Malhi; Alexandre A Oliveira; Angela Cano; Bianca Weiss Albuquerque; Corine Vriesendorp; Diego Felipe Correa; Emilio Vilanova Torre; Geertje van der Heijden; Hirma Ramirez-Angulo; José Ferreira Ramos; Kenneth R Young; Maira Rocha; Marcelo Trindade Nascimento; Maria Natalia Umaña Medina; Milton Tirado; Ophelia Wang; Rodrigo Sierra; Armando Torres-Lezama; Casimiro Mendoza; Cid Ferreira; Cláudia Baider; Daniel Villarroel; Henrik Balslev; Italo Mesones; Ligia Estela Urrego Giraldo; Luisa Fernanda Casas; Manuel Augusto Ahuite Reategui; Reynaldo Linares-Palomino; Roderick Zagt; Sasha Cárdenas; William Farfan-Rios; Adeilza Felipe Sampaio; Daniela Pauletto; Elvis H Valderrama Sandoval; Freddy Ramirez Arevalo; Isau Huamantupa-Chuquimaco; Karina Garcia-Cabrera; Lionel Hernandez; Luis Valenzuela Gamarra; Miguel N Alexiades; Susamar Pansini; Walter Palacios Cuenca; William Milliken; Joana Ricardo; Gabriela Lopez-Gonzalez; Edwin Pos; Hans Ter Steege

doi:10.1038/s41598-017-18927-1

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Species Distribution Modelling: Contrasting presence-only models with plot abundance data

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Species Distribution Modelling: Contrasting presence-only models with plot abundance data

Vitor H F Gomes, Stéphanie D IJff, Niels Raes, Iêda Leão Amaral, Rafael P Salomão, Luiz de Souza Coelho, Francisca Dionízia de Almeida Matos, Carolina V Castilho, Diogenes de Andrade Lima Filho, Dairon Cárdenas López, …

Scientific reports, Vol.8(1), pp.1003-12

2018-01-17

DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-017-18927-1

PMCID: PMC5772443

PMID: 29343741

Abstract

Chrysobalanaceae - physiology

Polygonaceae - physiology

Trees - physiology

Humans

Brazil

Conservation of Natural Resources - statistics & numerical data

Models, Statistical

Fabaceae - physiology

Plant Dispersal - physiology

Species distribution models (SDMs) are widely used in ecology and conservation. Presence-only SDMs such as MaxEnt frequently use natural history collections (NHCs) as occurrence data, given their huge numbers and accessibility. NHCs are often spatially biased which may generate inaccuracies in SDMs. Here, we test how the distribution of NHCs and MaxEnt predictions relates to a spatial abundance model, based on a large plot dataset for Amazonian tree species, using inverse distance weighting (IDW). We also propose a new pipeline to deal with inconsistencies in NHCs and to limit the area of occupancy of the species. We found a significant but weak positive relationship between the distribution of NHCs and IDW for 66% of the species. The relationship between SDMs and IDW was also significant but weakly positive for 95% of the species, and sensitivity for both analyses was high. Furthermore, the pipeline removed half of the NHCs records. Presence-only SDM applications should consider this limitation, especially for large biodiversity assessments projects, when they are automatically generated without subsequent checking. Our pipeline provides a conservative estimate of a species' area of occupancy, within an area slightly larger than its extent of occurrence, compatible to e.g. IUCN red list assessments.

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Citation topics: 3 Agriculture, Environment & Ecology; 3.40 Forestry; 3.40.195 MaxEnt
Web Of Science research areas: Ecology
ESI research areas: Environment/Ecology

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Source: InCites

Details

Title: Species Distribution Modelling: Contrasting presence-only models with plot abundance data
Creators: Vitor H F Gomes - Programa de Pós-Graduação em Ciência Ambientais, Universidade Federal do Pará, Rua Augusto Corrêa 01, Belém, PA, 66075-110, Brazil
Stéphanie D IJff - Marine and Coastal Management, Deltares, Boussinesqweg 1, Delft, 2629 HV, The Netherlands
Niels Raes - Biodiversity Dynamics, Naturalis Biodiversity Center, PO Box 9517, Leiden, 2300 RA, The Netherlands
Iêda Leão Amaral - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Rafael P Salomão - Programa de Pós-Graduação em Ciência Ambientais, Universidade Federal do Pará, Rua Augusto Corrêa 01, Belém, PA, 66075-110, Brazil
Luiz de Souza Coelho - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Francisca Dionízia de Almeida Matos - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Carolina V Castilho - EMBRAPA - Centro de Pesquisa Agroflorestal de Roraima, BR 174 km 8, Distrito Industrial, Boa Vista, RR, 69301-970, Brazil
Diogenes de Andrade Lima Filho - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Dairon Cárdenas López - Herbario Amazónico Colombiano, Instituto SINCHI, Calle 20 No 5-44, Bogotá, DC, Colombia
Juan Ernesto Guevara - Universidad San Francisco de Quito, Colegio de Ciencias Biológicas, Diego de Robles y Vía Interoceánica, Quito, Pichincha, Ecuador
William E Magnusson - Coordenação de Pesquisas em Ecologia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Oliver L Phillips - School of Geography, University of Leeds, Woodhouse Lane, Leeds, LS2 9JT, UK
Florian Wittmann - Biogeochemistry, Max Planck Institute for Chemistry, Hahn-Meitner Weg 1, Mainz, 55128, Germany
Marcelo de Jesus Veiga Carim - Departamento de Botânica, Instituto de Pesquisas Científicas e Tecnológicas do Amapá - IEPA, Rodovia JK Km 10, Campus do IEPA da Fazendinha, Amapá, 68901-025, Brazil
Maria Pires Martins - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Mariana Victória Irume - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Daniel Sabatier - AMAP, IRD, Cirad, CNRS, INRA, Université de Montpellier, TA A-51/PS2, Bd. de la Lironde, Montpellier, 34398, France
Jean-François Molino - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Olaf S Bánki - Biodiversity Dynamics, Naturalis Biodiversity Center, PO Box 9517, Leiden, 2300 RA, The Netherlands
José Renan da Silva Guimarães - Departamento de Botânica, Instituto de Pesquisas Científicas e Tecnológicas do Amapá - IEPA, Rodovia JK Km 10, Campus do IEPA da Fazendinha, Amapá, 68901-025, Brazil
Nigel C A Pitman - Science and Education, The Field Museum, 1400 S. Lake Shore Drive, Chicago, IL, 60605-2496, USA
Maria Teresa Fernandez Piedade - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Abel Monteagudo Mendoza - Jardín Botánico de Missouri, Oxapampa, Pasco, Peru
Bruno Garcia Luize - Departamento de Ecologia, Universidade Estadual Paulista - UNESP, Instituto de Biociências - IB, Av. 24 A 1515, Bela Vista, Rio Claro, SP, 13506-900, Brazil
Eduardo Martins Venticinque - Centro de Biociências, Departamento de Ecologia, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Av. Senador Salgado Filho 3000, Natal, RN, 59072-970, Brazil
Evlyn Márcia Moraes de Leão Novo - Divisao de Sensoriamento Remoto - DSR, Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais - INPE, Av. dos Astronautas 1758, Jardim da Granja, São José dos Campos, SP, 12227-010, Brazil
Percy Núñez Vargas - Herbario Vargas, Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco, Avenida de la Cultura, Nro 733, Cusco, Cuzco, Peru
Thiago Sanna Freire Silva - Departamento de Geografia, Universidade Estadual Paulista - UNESP, Instituto de Geociências e Ciências Extas - IGCE, Bela Vista, Rio Claro, SP, 13506-900, Brazil
Angelo Gilberto Manzatto - Departamento de Biologia, Universidade Federal de Rondônia, Rodovia BR 364 s/n Km 9.5, Rural, Porto Velho, RO, 76.824-027, Brazil
John Terborgh - Center for Tropical Conservation, Duke University, Nicholas School of the Environment, Durham, NC, 27708, USA
Neidiane Farias Costa Reis - Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Biotecnologia - PPG-Bionorte, Universidade Federal de Rondônia, Campus Porto Velho, Km 9.5, Rural, Porto Velho, RO, 76.824-027, Brazil
Juan Carlos Montero - Instituto Boliviano de Investigacion Forestal, Av. 6 de agosto 28 Km 14, Doble via La Guardia Casilla, 6204, Santa Cruz, Santa Cruz, Bolivia
Katia Regina Casula - Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Biotecnologia - PPG-Bionorte, Universidade Federal de Rondônia, Campus Porto Velho, Km 9.5, Rural, Porto Velho, RO, 76.824-027, Brazil
Beatriz S Marimon - Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação, Universidade do Estado de Mato Grosso, Nova Xavantina, MT, Brazil
Ben-Hur Marimon - Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação, Universidade do Estado de Mato Grosso, Nova Xavantina, MT, Brazil
Euridice N Honorio Coronado - Instituto de Investigaciones de la Amazonía Peruana - IIAP, Av. A. Quiñones km 2.5, Iquitos, Loreto, 784, Peru
Ted R Feldpausch - Geography College of Life and Environmental Sciences, University of Exeter, Exeter, EX4 4RJ, UK
Alvaro Duque - Departamento de Ciencias Forestales, Universidad Nacional de Colombia, Calle 64 x Cra 65, Medellín, Antioquia, 1027, Colombia
Charles Eugene Zartman - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Nicolás Castaño Arboleda - Herbario Amazónico Colombiano, Instituto SINCHI, Calle 20 No 5-44, Bogotá, DC, Colombia
Timothy J Killeen - Agteca-Amazonica, Santa Cruz, Bolivia
Bonifacio Mostacedo - Facultad de Ciencias Agrícolas Universidad Autónoma Gabriel René Moreno Santa Cruz, Santa Cruz, Bolivia
Rodolfo Vasquez - Jardín Botánico de Missouri, Oxapampa, Pasco, Peru
Jochen Schöngart - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Rafael L Assis - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Marcelo Brilhante Medeiros - Prédio da Botânica e Ecologia Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia Parque Estação Biológica, Av. W5 Norte, Brasilia, DF, 70770-917, Brazil
Marcelo Fragomeni Simon - Prédio da Botânica e Ecologia Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia Parque Estação Biológica, Av. W5 Norte, Brasilia, DF, 70770-917, Brazil
Ana Andrade - Projeto Dinâmica Biológica de Fragmentos Florestais, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
William F Laurance - Centre for Tropical Environmental and Sustainability Science and College of Science and Engineering James Cook University, Cairns, Queensland, 4870, Australia
José Luís Camargo - Projeto Dinâmica Biológica de Fragmentos Florestais, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Layon O Demarchi - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Susan G W Laurance - Centre for Tropical Environmental and Sustainability Science and College of Science and Engineering James Cook University, Cairns, Queensland, 4870, Australia
Emanuelle de Sousa Farias - Programa de Pós-graduação em Biodiversidade e Saúde Instituto Oswaldo Cruz - IOC/FIOCRUZ Pav. Arthur Neiva - Térreo Av. Brasil 4365 - Manguinhos, Rio de Janeiro, RJ, 21040-360, Brazil
Henrique Eduardo Mendonça Nascimento - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Juan David Cardenas Revilla - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Adriano Quaresma - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Flavia R C Costa - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Ima Célia Guimarães Vieira - Coordenação de Botânica, Museu Paraense Emílio Goeldi, Av. Magalhães Barata 376, C.P. 399, Belém, PA, 66040-170, Brazil
Bruno Barçante Ladvocat Cintra - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Hernán Castellanos - Centro de Investigaciones Ecológicas de Guayana Universidad Nacional Experimental de Guayana, Calle Chile, urbaniz Chilemex, Puerto Ordaz, Bolivar, Venezuela
Roel Brienen - School of Geography, University of Leeds, Woodhouse Lane, Leeds, LS2 9JT, UK
Pablo R Stevenson - Laboratorio de Ecología de Bosques Tropicales y Primatología Universidad de los Andes Carrera 1 # 18a- 10, Bogotá, DC, 111711, Colombia
Yuri Feitosa - Programa de Pós-Graduação em Biologia (Botânica) Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Joost F Duivenvoorden - Institute of Biodiversity and Ecosystem Dynamics University of Amsterdam, Sciencepark 904, Amsterdam, 1098 XH, The Netherlands
Gerardo A Aymard C - Programa de Ciencias del Agro y el Mar Herbario Universitario (PORT) UNELLEZ-Guanare, Guanare, Portuguesa, 3350, Venezuela
Hugo F Mogollón - Endangered Species Coalition, 8530 Geren Rd, Silver Spring, MD, 20901, USA
Natalia Targhetta - MAUA Working Group Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
James A Comiskey - Center for Conservation Education and Sustainability Smithsonian Conservation Biology Institute, 1100 Jefferson Dr. SW, Suite 3123, Washington, DC, 20560-0705, USA
Alberto Vicentini - Coordenação de Pesquisas em Ecologia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Aline Lopes - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Gabriel Damasco - Department of Integrative Biology University of California, Berkeley, CA, 94720-3140, USA
Nállarett Dávila - Biologia Vegetal, Universidade Estadual de Campinas, Caixa Postal 6109, Campinas, SP, 13.083-970, Brazil
Roosevelt García-Villacorta - Royal Botanic Garden Edinburgh 20a Inverleith Row, Edinburgh, Scotland, EH3 5LR, UK
Carolina Levis - Forest Ecology and Forest Management Group Wageningen University Wageningen University & Research, Droevendaalsesteeg 3, Wageningen, P.O. Box 47, 6700 AA, The Netherlands
Juliana Schietti - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Priscila Souza - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Thaise Emilio - Natural Capital and Plant Health Royal Botanic Gardens, Kew, Richmond, Surrey, TW9 3AB, UK
Alfonso Alonso - Center for Conservation Education and Sustainability Smithsonian Conservation Biology Institute, 1100 Jefferson Dr. SW, Suite 3123, Washington, DC, 20560-0705, USA
David Neill - Ecosistemas Biodiversidad y Conservación de Especies Universidad Estatal Amazónica, Km. 2 1/2 vía a Tena (Paso Lateral), Puyo, Pastaza, Ecuador
Francisco Dallmeier - Center for Conservation Education and Sustainability Smithsonian Conservation Biology Institute, 1100 Jefferson Dr. SW, Suite 3123, Washington, DC, 20560-0705, USA
Leandro Valle Ferreira - Coordenação de Botânica, Museu Paraense Emílio Goeldi, Av. Magalhães Barata 376, C.P. 399, Belém, PA, 66040-170, Brazil
Alejandro Araujo-Murakami - Museo de Historia Natural Noel Kempff Mercado Universidad Autónoma Gabriel Rene Moreno, Avenida Irala 565 Casilla Postal 2489, Santa Cruz, Santa Cruz, Bolivia
Daniel Praia - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Dário Dantas do Amaral - Coordenação de Botânica, Museu Paraense Emílio Goeldi, Av. Magalhães Barata 376, C.P. 399, Belém, PA, 66040-170, Brazil
Fernanda Antunes Carvalho - Centro de Biociências, Departamento de Botânica e Zoologia, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Campus Universitário, Lagoa Nova, Natal, RN, 59078-970, Brazil
Fernanda Coelho de Souza - School of Geography, University of Leeds, Woodhouse Lane, Leeds, LS2 9JT, UK
Kenneth Feeley - Fairchild Tropical Botanic Garden Coral, Gables, FL, 33156, USA
Luzmila Arroyo - Museo de Historia Natural Noel Kempff Mercado Universidad Autónoma Gabriel Rene Moreno, Avenida Irala 565 Casilla Postal 2489, Santa Cruz, Santa Cruz, Bolivia
Marcelo Petratti Pansonato - Instituto de Biociências - Dept. Ecologia, Universidade de Sao Paulo - USP, Rua do Matão, Trav. 14, no. 321, Cidade Universitária, São Paulo, SP, 05508-090, Brazil
Rogerio Gribel - Diretoria de Pesquisas Científicas, Instituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ, Brazil
Boris Villa - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Juan Carlos Licona - Instituto Boliviano de Investigacion Forestal, Av. 6 de agosto 28 Km 14, Doble via La Guardia Casilla, 6204, Santa Cruz, Santa Cruz, Bolivia
Paul V A Fine - Department of Integrative Biology University of California, Berkeley, CA, 94720-3140, USA
Carlos Cerón - Escuela de Biología Herbario Alfredo Paredes Universidad Central, Ap. Postal 17.01.2177, Quito, Pichincha, Ecuador
Chris Baraloto - International Center for Tropical Botany (ICTB) Department of Biological Sciences Florida International University, 11200 SW 8th Street, OE 243, Miami, FL, 33199, USA
Eliana M Jimenez - Grupo de Ecología de Ecosistemas Terrestres Tropicales, Universidad Nacional de Colombia Sede Amazonía, Leticia, Amazonas, Colombia
Juliana Stropp - Institute of Biological and Health Sciences, Federal University of Alagoas, Av. Lourival Melo Mota, s/n, Tabuleiro do Martins, Maceio, AL, 57072-970, Brazil
Julien Engel - International Center for Tropical Botany (ICTB) Department of Biological Sciences Florida International University, 11200 SW 8th Street, OE 243, Miami, FL, 33199, USA
Marcos Silveira - Museu Universitário/Centro de Ciências Biológicas e da Natureza/Laboratório de Botânica e Ecologia Vegetal, Universidade Federal do Acre, Rio Branco, AC, 69915-559, Brazil
Maria Cristina Peñuela Mora - Universidad Regional Amazónica IKIAM, Km 7 via Muyuna, Tena, Napo, Ecuador
Pascal Petronelli - Cirad UMR Ecofog AgrosParisTech CNRS INRA Univ Guyane, Campus agronomique, Kourou Cedex, 97379, France
Paul Maas - Biodiversity Dynamics, Naturalis Biodiversity Center, PO Box 9517, Leiden, 2300 RA, The Netherlands
Raquel Thomas-Caesar - Iwokrama International Programme for Rainforest Conservation, Georgetown, Guyana
Terry W Henkel - Department of Biological Sciences, Humboldt State University, 1 Harpst Street, Arcata, CA, 95521, USA
Doug Daly - New York Botanical Garden 2900 Southern Blvd, Bronx, New York, NY, 10458-5126, USA
Marcos Ríos Paredes - Servicios de Biodiversidad EIRL, Jr. Independencia 405, Iquitos, Loreto, 784, Peru
Tim R Baker - School of Geography, University of Leeds, Woodhouse Lane, Leeds, LS2 9JT, UK
Alfredo Fuentes - Missouri Botanical Garden, P.O. Box 299, St. Louis, MO, 63166-0299, USA
Carlos A Peres - School of Environmental Sciences, University of East Anglia, Norwich, NR4 7TJ, UK
Jerome Chave - Laboratoire Evolution et Diversité Biologique CNRS and Université Paul Sabatier UMR 5174 EDB, Toulouse, 31000, France
Jose Luis Marcelo Pena - Department of Forestry Management, Universidad Nacional Agraria La Molina, Avenido La Molina, Apdo. 456, La Molina, Lima, Peru
Kyle G Dexter - School of Geosciences University of Edinburgh, 201 Crew Building, King's Buildings, Edinburgh, EH9 3JN, UK
Miles R Silman - Biology Department and Center for Energy, Environment and Sustainability, Wake Forest University, 1834 Wake Forest Rd, Winston Salem, NC, 27106, USA
Peter Møller Jørgensen - Missouri Botanical Garden, P.O. Box 299, St. Louis, MO, 63166-0299, USA
Toby Pennington - Royal Botanic Garden Edinburgh 20a Inverleith Row, Edinburgh, Scotland, EH3 5LR, UK
Anthony Di Fiore - Department of Anthropology University of Texas at Austin, SAC 5.150, 2201 Speedway Stop C3200, Austin, TX, 78712, USA
Fernando Cornejo Valverde - Andes to Amazon Biodiversity Program, Madre de Dios, Madre de Dios, Peru
Juan Fernando Phillips - Fundación Puerto Rastrojo, Cra 10 No. 24-76 Oficina 1201, Bogotá, DC, Colombia
Gonzalo Rivas-Torres - Department of Wildlife Ecology and Conservation University of Florida, 110 Newins-Ziegler Hall, Gainesville, FL, 32611, USA
Patricio von Hildebrand - Fundación Estación de Biología, Cra 10 No. 24-76 Oficina 1201, Bogotá, DC, Colombia
Tinde R van Andel - Biodiversity Dynamics, Naturalis Biodiversity Center, PO Box 9517, Leiden, 2300 RA, The Netherlands
Ademir R Ruschel - Embrapa Amazônia Oriental, Trav. Dr. Enéas Pinheiro s/nº, Belém, PA, 66095-100, Brazil
Adriana Prieto - Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia, Apartado, 7945, Bogotá, DC, Colombia
Agustín Rudas - Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia, Apartado, 7945, Bogotá, DC, Colombia
Bruce Hoffman - Amazon Conservation Team, Doekhieweg Oost #24, Paramaribo, Suriname
César I A Vela - Facultad de Ciencias Forestales y Medio Ambiente, Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco, Jirón San Martín 451, Puerto Maldonado, Madre de Dios, Peru
Edelcilio Marques Barbosa - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Egleé L Zent - Laboratory of Human Ecology, Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas - IVIC, Ado 20632, Caracas, Caracas, 1020A, Venezuela
George Pepe Gallardo Gonzales - Servicios de Biodiversidad EIRL, Jr. Independencia 405, Iquitos, Loreto, 784, Peru
Hilda Paulette Dávila Doza - Servicios de Biodiversidad EIRL, Jr. Independencia 405, Iquitos, Loreto, 784, Peru
Ires Paula de Andrade Miranda - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Jean-Louis Guillaumet - Departement EV, Muséum national d'histoire naturelle de Paris, 16 rue Buffon, Paris, 75005, France
Linder Felipe Mozombite Pinto - Servicios de Biodiversidad EIRL, Jr. Independencia 405, Iquitos, Loreto, 784, Peru
Luiz Carlos de Matos Bonates - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Natalino Silva - Instituto de Ciência Agrárias, Universidade Federal Rural da Amazônia, Av. Presidente Tancredo Neves 2501, Belém, PA, 66.077-901, Brazil
Ricardo Zárate Gómez - PROTERRA, Instituto de Investigaciones de la Amazonía Peruana (IIAP), Av. A. Quiñones km 2 5, Iquitos, Loreto, 784, Peru
Stanford Zent - Laboratory of Human Ecology, Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas - IVIC, Ado 20632, Caracas, Caracas, 1020A, Venezuela
Therany Gonzales - ACEER Foundation, Jirón Cusco N° 370, Puerto Maldonado, Madre de Dios, Peru
Vincent A Vos - Regional Norte Amazónico, Centro de Investigación y Promoción del Campesinado, C/Nicanor Gonzalo Salvatierra N° 362, Riberalta, Beni, Bolivia
Yadvinder Malhi - Environmental Change Institute, Oxford University Centre for the Environment, Dyson Perrins Building, South Parks Road, Oxford, England, OX1 3QY, UK
Alexandre A Oliveira - Instituto de Biociências - Dept. Ecologia, Universidade de Sao Paulo - USP, Rua do Matão, Trav. 14, no. 321, Cidade Universitária, São Paulo, SP, 05508-090, Brazil
Angela Cano - Laboratorio de Ecología de Bosques Tropicales y Primatología Universidad de los Andes Carrera 1 # 18a- 10, Bogotá, DC, 111711, Colombia
Bianca Weiss Albuquerque - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Corine Vriesendorp - Science and Education, The Field Museum, 1400 S. Lake Shore Drive, Chicago, IL, 60605-2496, USA
Diego Felipe Correa - School of Agriculture and Food Sciences - ARC Centre of Excellence for Environmental Decisions CEED, The University of Queensland, St. Lucia, QLD 4072, Australia
Emilio Vilanova Torre - School of Environmental and Forest Sciences, University of Washington, Seattle, WA, 98195-2100, USA
Geertje van der Heijden - University of Nottingham, University Park, Nottingham, NG7 2RD, UK
Hirma Ramirez-Angulo - Instituto de Investigaciones para el Desarrollo Forestal (INDEFOR), Universidad de los Andes, Conjunto Forestal, C.P. 5101, Mérida, Mérida, Venezuela
José Ferreira Ramos - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Kenneth R Young - Geography and the Environment, University of Texas at Austin, 305 E. 23rd Street, CLA building, Austin, TX, 78712, USA
Maira Rocha - Coordenação de Dinâmica Ambiental, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Marcelo Trindade Nascimento - Laboratório de Ciências Ambientais, Universidade Estadual do Norte Fluminense, Av. Alberto Lamego 2000, Campos dos Goyatacazes, RJ, 28013-620, Brazil
Maria Natalia Umaña Medina - Department of Biology, University of Maryland, College Park, MD, 20742, USA
Milton Tirado - GeoIS, El Día 369 y El Telégrafo, 3° Piso, Quito, Pichincha, Ecuador
Ophelia Wang - Environmental Science and Policy, Northern Arizona University, Flagstaff, AZ, 86011, USA
Rodrigo Sierra - GeoIS, El Día 369 y El Telégrafo, 3° Piso, Quito, Pichincha, Ecuador
Armando Torres-Lezama - Instituto de Investigaciones para el Desarrollo Forestal (INDEFOR), Universidad de los Andes, Conjunto Forestal, C.P. 5101, Mérida, Mérida, Venezuela
Casimiro Mendoza - Escuela de Ciencias Forestales (ESFOR), Universidad Mayor de San Simon (UMSS), Sacta, Cochabamba, Bolivia
Cid Ferreira - Coordenação de Biodiversidade, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA, Av. André Araújo 2936, Petrópolis, Manaus, AM, 69067-375, Brazil
Cláudia Baider - Agricultural Services, Ministry of Agro-Industry and Food Security, Agricultural Services, Ministry of Agro-Industry and Food Security, The Mauritius Herbarium, Reduit, Mauritius
Daniel Villarroel - Museo de Historia Natural Noel Kempff Mercado Universidad Autónoma Gabriel Rene Moreno, Avenida Irala 565 Casilla Postal 2489, Santa Cruz, Santa Cruz, Bolivia
Henrik Balslev - Department of Bioscience, Aarhus University, Building 1540 Ny Munkegade, Aarhus C, Aarhus, DK-8000, Denmark
Italo Mesones - Department of Integrative Biology University of California, Berkeley, CA, 94720-3140, USA
Ligia Estela Urrego Giraldo - Departamento de Ciencias Forestales, Universidad Nacional de Colombia, Calle 64 x Cra 65, Medellín, Antioquia, 1027, Colombia
Luisa Fernanda Casas - Ciencias Biológicas, Universidad de Los Andes, Carrera 1 # 18a- 10, Bogotá, DC, 111711, Colombia
Manuel Augusto Ahuite Reategui - Medio Ambiente, PLUSPRETOL, Iquitos, Loreto, Peru
Reynaldo Linares-Palomino - Center for Conservation Education and Sustainability, Smithsonian's National Zoo & Conservation Biology Institute, National Zoological Park, 3001 Connecticut Ave, Washington, DC, 20008, USA
Roderick Zagt - Tropenbos International, Lawickse Allee 11 PO Box 232, Wageningen, 6700 AE, The Netherlands
Sasha Cárdenas - Ciencias Biológicas, Universidad de Los Andes, Carrera 1 # 18a- 10, Bogotá, DC, 111711, Colombia
William Farfan-Rios - Biology Department and Center for Energy, Environment and Sustainability, Wake Forest University, 1834 Wake Forest Rd, Winston Salem, NC, 27106, USA
Adeilza Felipe Sampaio - Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Biotecnologia - PPG-Bionorte, Universidade Federal de Rondônia, Campus Porto Velho, Km 9.5, Rural, Porto Velho, RO, 76.824-027, Brazil
Daniela Pauletto - Instituto de Biodiversidade e Floresta, Universidade Federal do Oeste do Pará, Rua Vera Paz, Campus Tapajós, Santarém, PA, 68015-110, Brazil
Elvis H Valderrama Sandoval - Facultad de Biologia, Universidad Nacional de la Amazonia Peruana, Pevas 5ta cdra, Iquitos, Loreto, Peru
Freddy Ramirez Arevalo - Facultad de Biologia, Universidad Nacional de la Amazonia Peruana, Pevas 5ta cdra, Iquitos, Loreto, Peru
Isau Huamantupa-Chuquimaco - Herbario Vargas, Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco, Avenida de la Cultura, Nro 733, Cusco, Cuzco, Peru
Karina Garcia-Cabrera - Biology Department and Center for Energy, Environment and Sustainability, Wake Forest University, 1834 Wake Forest Rd, Winston Salem, NC, 27106, USA
Lionel Hernandez - Centro de Investigaciones Ecológicas de Guayana Universidad Nacional Experimental de Guayana, Calle Chile, urbaniz Chilemex, Puerto Ordaz, Bolivar, Venezuela
Luis Valenzuela Gamarra - Jardín Botánico de Missouri, Oxapampa, Pasco, Peru
Miguel N Alexiades - School of Anthropology and Conservation, University of Kent, Marlowe Building, Canterbury, Kent, CT2 7NR, UK
Susamar Pansini - Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Biotecnologia - PPG-Bionorte, Universidade Federal de Rondônia, Campus Porto Velho, Km 9.5, Rural, Porto Velho, RO, 76.824-027, Brazil
Walter Palacios Cuenca - Herbario Nacional del Ecuador, Universidad Técnica del Norte, Quito, Pichincha, Ecuador
William Milliken - Natural Capital and Plant Health Royal Botanic Gardens, Kew, Richmond, Surrey, TW9 3AB, UK
Joana Ricardo - School of Geography, University of Leeds, Woodhouse Lane, Leeds, LS2 9JT, UK
Gabriela Lopez-Gonzalez - School of Geography, University of Leeds, Woodhouse Lane, Leeds, LS2 9JT, UK
Edwin Pos - Ecology & Biodiversity Group, Utrecht University, Padualaan 8, Utrecht, 3584 CH, The Netherlands
Hans Ter Steege - Systems Ecology, Free University, De Boelelaan 1087, Amsterdam, 1081 HV, Netherlands. hans.tersteege@naturalis.nl
Publication Details: Scientific reports, Vol.8(1), pp.1003-12
Publisher: England
Academic Unit: College of A&S; A&S - Biology
Language: English
Resource Type: Journal article
PMID: 29343741
PMCID: PMC5772443
Record Identifier: 991031576181902976